Köy halkı,  Oğuzların 24 boyundan biri ve Kaşgarlı Mahmud'a göre Divân-ı Lügati't-Türk'deki yirmi iki Oğuz bölüğünden ondördüncüsü; "İgdir"lere mensup Azerbaycan, Dağistan ve İran Horasan Türklerinden oluşmaktadır.Eski adı Arapkirli Köyü 'dür. 1980 yılında Bayraktutan Köyü olmuştur. Köy Ermenistan sınırında olduğundan Ermenilerle ortak bir yaşantı sürülmüştür taa ki I. Dünya Savaşına kadar. 1915 olaylarında Ermeni çetelerinin zulmünde kaçmak zorunda olan köylüler genelde İran'ın Hoy şehrinde, Van'ın Erciş İlçesinde, Ağrı'nın Karaköse ilçelerinde yaşamışlardır. Cumhuriyetin ilanından sonraki dönemde geri dönüş başlamıştır.Oğuz Türk'lerinin kültür, gelenek ve görenekleri yaşanmaktadır. Geleneklerine sahiptirler.Iğdır'ın merkezine 17 km uzaklıktadır.Köyün doğusunda Hakmemet ve Kuzugüden Köyleri, Batısında Çalpala Köyü, Güneyinde Küllük Köyü, Kuzeyinde ise Ermenistan Devleti bulunmaktadır. Köy Ermenistan sınırında bulunmaktadır. Köy sulama kanallarının başladığı noktada olduğundan tamamiyle yeşile teslim olmuştur.Köyün iklimi, kara iklimi etki alanı içerisindedir. Genel olarak Çukurova iklimi yaşanır.Köyün ekonomisi tarım ve hayvancılığa dayalıdır. Tarıma bağlı olarak meyve yetiştiriciği yaygın olarak yapılmaktadır. Kayısı ve elma yaygın meyvelerdendir.Yerleşim yerinin köy tüzel kişiliği alması ile birlikte köyün tüzel kişiliğini temsil etmesi için köy muhtarlık seçimleri de yapılmaktadır. ..2009...- Mehmet genceKöyün içme suyu şebekesi vardır Bayraktutan Köyünün içme suyu köyün Güneyinde yer alan Toros Sıradağlarının eteklerinde bulunan Mamagan Bulağından [[Mamağan Bulağı] civardaki 5 adet köyün içme suyunu sağlamaktadır.] gelmektedir.kanalizasyon şebekesi yoktur. PTT şubesi yoktur. Sağlık ocağı vardır. Köye ayrıca ulaşımı sağlayan yol asfalt olup köyde elektrik ve sabit telefon vardır.